Atbilstoši Ministru kabineta rīkojumam Nr. 509. (29.07.2009.) „Par Veselības ministrijas padotībā esošo valsts pārvaldes iestāžu reorganizāciju” ar 2009.gada 1.oktobri beidz pastāvēt Veselības statistikas un medicīnas tehnoloģiju valsts aģentūra un tās funkcijas tiek sadalītas starp Veselības ekonomikas centru, Veselības inspekciju un Zāļu valsts aģentūru.

Veselības statistikas un medicīnas tehnoloģiju valsts aģentūra funkciju, pārvaldes uzdevumu, tiesību, saistību, finanšu līdzekļu, mantas un lietvedības pārņēmēji ir:

1. Veselības ekonomikas centrs šādās jomās:

1.        sabiedrības veselības un veselības aprūpes statistiskās informā­cijas iegūšana, apkopošana, apstrāde un analīze;

2.        ar noteiktām slimībām slimojošu pacientu reģistra papildināšana un uzturēšana;

3.        e-veselības pamatnostādņu ieviešana;

4.        Eiropas Savienības fondu sadarbības iestādes funkciju veikšana;

5.        ārstniecībā izmantojamo medicīnisko tehnoloģiju apstiprināšana.

2. Veselības inspekcija šādās jomās:

1.        ārstniecības iestāžu atbilstības normatīvajos aktos noteiktajām obligātajām prasībām kontrole;

2.        veselības nozares kontrole un tirgus uzraudzība veselības aprūpes un farmācijas jomā, tai skaitā medicīnisko ierīču lietotāju un ražotāju uzraudzības audita nodrošināšana;

3.        ārstniecības personu un ārstniecības iestāžu reģistru papildināšana un uzturēšana.

3. Zāļu valsts aģentūra šādās jomās:

1.        medicīnisko ierīču reģistrācija;

3.        modrības sistēmas (Vigilance) nodrošināšana un nepārtraukta tehniskā uzraudzība;

4.        ārstniecības iestāžu asins kabinetu, Valsts asinsdonoru centra un asins sagatavošanas nodaļu atbilstības novērtēšana;

5.        audu un orgānu ieguves un uzglabāšanas centru atbilstības novērtēšana;

6.        zāļu, medicīnas ierīču un medicīnas tehnoloģiju atbilstības novērtēšana un lietošanas drošības uzraudzība;

7.        medicīnisko ierīču klīnisko pētījumu uzraudzība.